Sự khác biệt giữa thắt cùn và kết thúc dính

Sự khác biệt chính - Sự kết thúc cùn và kết thúc
 

Endonuclease hạn chế là các enzyme cụ thể cắt DNA sợi đôi (DSDNA). Chúng còn được gọi là kéo phân tử trong sinh học phân tử. Các enzyme hạn chế có thể nhận ra các chuỗi ngắn cụ thể của DSDNA được gọi là các vị trí nhận biết và tách các liên kết phosphodiester và hydro để mở các chuỗi kép. Kết quả của sự phân tách bởi các enzyme này, các đoạn DNA được tạo ra với các loại đầu khác nhau như đầu dính và đầu cùn. DNA ligase là một enzyme được sử dụng trong sinh học Phân tử để nối hai chuỗi DNA liền kề bằng cách hình thành các liên kết mới. Bước này được gọi là thắt và theo loại kết thúc DNA, chúng có thể được gọi là thắt cuối cùn và thắt cuối dính. Sự khác biệt chính giữa thắt cùn và kết thúc dính là thắt đầu cùn xảy ra giữa các đoạn DNA chứa hai đầu cùn trong khi thắt cuối dính xảy ra giữa 5 'và 3' nhô ra. So với thắt đầu cùn, thắt đầu dính hiệu quả và ổn định hơn.

NỘI DUNG
1. Tổng quan và sự khác biệt chính
2. Cách thắt cuối cùng là gì
3. Cách kết thúc dính là gì
4. So sánh cạnh nhau - Sự kết hợp cùn và kết thúc
5. Tóm tắt

Cách thắt cuối cùng là gì?

Một số endonuclease hạn chế có thể cắt DNA ở các cơ sở đối diện và tạo ra các đoạn DNA cuối cùn. Những enzyme này được gọi là máy cắt cùn; họ tách thẳng xuống giữa khu vực hạn chế mà không để lại các căn cứ nhô ra bị mắc kẹt. Các đầu cùn còn được gọi là các đầu không nhô ra vì chúng không có các đế nhô ra 3 'và 5' ở hai đầu. Cả hai sợi kết thúc từ các cặp cơ sở trong đầu cùn. Các enzyme cắt cùn phổ biến là EcoRV HaeIII, AluI và SmaI.

Thắt đầu cùn có liên quan giữa hai đầu cùn. Nó không phải là một thắt của các căn cứ nhô ra. Cách thắt này kém hiệu quả hơn so với thắt cuối. Tuy nhiên, trong một số trường hợp, thắt đầu cùn trở nên thuận lợi hơn so với thắt đầu dính, đặc biệt là khi thắt các sản phẩm PCR. Sản phẩm PCR luôn được sản xuất với đầu cùn. Thắt đầu cùn không yêu cầu kết thúc bổ sung trong DNA cho thắt.

Hình 01: Sản xuất cuối cùn bằng enzyme Eco RV

Thắt lưng dính là gì?

Một số endonuclease hạn chế có thể cắt DSDNA, để lại một đoạn DNA nhô ra ở cuối. Những kết thúc này được gọi là kết thúc dính hoặc nhô ra. Việc thắt đầu dính xảy ra giữa hai đoạn DNA có chứa phần nhô ra phù hợp vì các đầu dính được sở hữu các bazơ không ghép đôi và đòi hỏi các bazơ bổ sung để tạo liên kết. Do đó, cần phải sử dụng cùng một enzyme cắt giới hạn cho cả hai nguồn DNA để tạo ra các mảnh ghép phù hợp.

Việc thắt cuối dính hiệu quả hơn và thường rất được mong muốn trong quá trình nhân bản. Có một số enzyme hạn chế tạo ra kết thúc dính. Họ là EcoRI, BamHI, HindIII, v.v..

Hình 02: Sản xuất kết thúc dính bằng enzyme Eco RI

Sự khác biệt giữa cách xử lý cùn và kết thúc?

Blunt vs dính kết thúc
Sự kết thúc cùn xảy ra giữa hai đoạn DNA đầu cùn.	Việc thắt đầu dính xảy ra giữa hai đoạn DNA trùng khớp với đầu dính.
Enzyme
Máy cắt cùn sản xuất đầu cùn.	Dao cắt đầu dính tạo ra đầu dính hoặc dính.
Yêu cầu kết thúc phù hợp
Nó không yêu cầu các mảnh phù hợp hoặc cơ sở bổ sung.	Nó đòi hỏi các cơ sở bổ sung ở cuối để tạo thành các cặp cơ sở.
Hiệu quả
Nó ít hiệu quả hơn so với thắt cuối	Nó hiệu quả hơn so với thắt cuối cùn.

Tóm tắt - Cách xử lý kết thúc cùn

Các endonuclease hạn chế có thể phân tách DSDNA và tạo ra các đoạn DNA với các đầu khác nhau. Họ nhận ra các trình tự cụ thể và hạn chế DNA tạo ra các đầu dính và cùn. Kết thúc dính có cơ sở không ghép đôi ở cuối các mảnh. Các đầu cùn được tạo ra do sự phân tách thẳng và chúng có các cặp cơ sở ở hai đầu. Thắt cuối dính đòi hỏi hai mảnh DNA sợi đơn bổ sung. Thắt đầu cùn xảy ra giữa bất kỳ hai mảnh cuối cùn. Đây là sự khác biệt giữa thắt cùn và dính.

Người giới thiệu:
1. Roberts, Richard J .. Làm thế nào các enzyme hạn chế trở thành con ngựa của sinh học phân tử. Kỷ yếu của Viện Hàn lâm Khoa học Quốc gia. Viện Hàn lâm Khoa học Quốc gia, n.d. Web. Ngày 12 tháng 4 năm 2017
2. Ad Nam, Amna. Công dụng của Enzyme hạn chế trong công nghệ sinh học. N.p., n.d. Web. Ngày 12 tháng 4 năm 2017

Hình ảnh lịch sự:
1. Trang web hạn chế EcoRV.rsh bởi By Ramin Herati - Được tạo bằng Inkscape (Tên miền công cộng) qua Commons Wikimedia
2. Enzim hạn chế sinh thái Eco RI Thường của Tinastella - Công việc riêng (Miền công cộng) qua Commons Wikimedia