Đi bộ nhiễm sắc thể và nhảy nhiễm sắc thể là hai công cụ kỹ thuật được sử dụng trong sinh học phân tử để định vị gen trên nhiễm sắc thể và lập bản đồ vật lý của bộ gen. Đi bộ nhiễm sắc thể là một kỹ thuật được sử dụng để sao chép gen mục tiêu trong thư viện bộ gen bằng cách phân lập lặp lại và nhân bản vô tính liền kề của thư viện bộ gen. Nhảy nhiễm sắc thể là một phiên bản đặc biệt của đi bộ nhiễm sắc thể vượt qua các điểm dừng của đi bộ nhiễm sắc thể. Đi bộ nhiễm sắc thể chỉ có thể sắp xếp và lập bản đồ các đoạn nhiễm sắc thể nhỏ trong khi nhảy nhiễm sắc thể cho phép giải trình tự các phần lớn của nhiễm sắc thể. Đây là điểm khác biệt chính giữa đi bộ nhiễm sắc thể và nhảy nhiễm sắc thể.
NỘI DUNG
1. Tổng quan và sự khác biệt chính
2. Đi bộ nhiễm sắc thể là gì
3. Nhảy nhiễm sắc thể là gì
4. So sánh cạnh nhau - Đi bộ nhiễm sắc thể và Nhảy
5. Tóm tắt
Đi bộ nhiễm sắc thể là một công cụ khám phá các vùng nhiễm sắc thể không xác định bằng cách sử dụng các đoạn giới hạn chồng chéo. Trong đi bộ nhiễm sắc thể, một phần của một gen đã biết được sử dụng làm đầu dò và tiếp tục với việc mô tả toàn bộ chiều dài của nhiễm sắc thể được ánh xạ hoặc giải trình tự. Điều này đi từ điểm đánh dấu đến chiều dài mục tiêu. Trong đi bộ nhiễm sắc thể, các đầu của mỗi đoạn trùng lặp được sử dụng để lai để xác định trình tự tiếp theo.
Các đầu dò được chuẩn bị từ các đoạn cuối của DNA nhân bản và chúng được đăng ký. Sau đó, chúng được sử dụng để tìm các mảnh chồng chéo tiếp theo. Tất cả các chuỗi trùng lặp này được sử dụng để xây dựng bản đồ di truyền của nhiễm sắc thể và xác định vị trí các gen mục tiêu. Đây là một phương pháp phân tích các đoạn DNA dài bằng các đoạn nhỏ chồng chéo từ thư viện bộ gen được tái cấu trúc.
Phân lập đoạn DNA chứa gen đã biết hoặc điểm đánh dấu gần gen đích
Chuẩn bị bản đồ giới hạn của đoạn 2 và phân vùng của vùng kết thúc của đoạn 2 để làm đầu dò cho việc xác định đoạn trùng lặp tiếp theo
Các bước trên nên được tiếp tục cho đến khi gen mục tiêu hoặc tối đa 3 'cuối tổng chiều dài của chuỗi.
Hình 01: Kỹ thuật đi bộ nhiễm sắc thể
Đi bộ nhiễm sắc thể là một khía cạnh quan trọng của tế bào học trong việc tìm kiếm SNP của nhiều sinh vật và phân tích các bệnh di truyền và tìm đột biến của các gen liên quan.
Nhảy nhiễm sắc thể là một kỹ thuật được sử dụng trong sinh học phân tử để lập bản đồ vật lý bộ gen của các sinh vật. Kỹ thuật này đã được giới thiệu để vượt qua rào cản của việc đi bộ nhiễm sắc thể phát sinh khi tìm thấy các vùng DNA lặp đi lặp lại trong quá trình nhân bản. Do đó, kỹ thuật nhảy nhiễm sắc thể có thể được coi là một phiên bản đặc biệt của đi bộ nhiễm sắc thể. Đây là một phương pháp nhanh chóng so với đi bộ nhiễm sắc thể và cho phép bỏ qua các chuỗi DNA lặp đi lặp lại mà không dễ bị nhân bản trong quá trình đi bộ nhiễm sắc thể. Nhảy nhiễm sắc thể thu hẹp khoảng cách giữa gen mục tiêu và các dấu hiệu đã biết có sẵn để lập bản đồ gen.
Công cụ nhảy nhiễm sắc thể bắt đầu bằng việc cắt một DNA cụ thể với các endonuclease hạn chế đặc biệt và thắt các đoạn thành các vòng tròn. Sau đó, một mồi được thiết kế từ một trình tự đã biết được sử dụng để sắp xếp các vòng lặp tròn. Primer này cho phép nhảy và giải trình tự theo cách khác. Do đó, nó có thể bỏ qua các chuỗi DNA lặp đi lặp lại và nhanh chóng đi qua nhiễm sắc thể để tìm kiếm gen mục tiêu.
Việc phát hiện ra gen mã hóa cho bệnh xơ nang được thực hiện bằng công cụ nhảy nhiễm sắc thể. Kết hợp với nhau, nhảy và đi bộ nhiễm sắc thể có thể tăng cường quá trình lập bản đồ bộ gen.
Hình 02: Nhảy nhiễm sắc thể
Đi bộ nhiễm sắc thể vs Nhảy | |
Nhiễm sắc thể là một công cụ được sử dụng trong sinh học phân tử để lập bản đồ gen và định vị các gen cụ thể. | Nhảy nhiễm sắc thể là một công cụ được sử dụng để lập bản đồ vật lý của bộ gen và tìm kiếm nhanh các gen mục tiêu trong nhiễm sắc thể. |
Độ dài so sánh của trình tự | |
Chỉ những mảnh nhỏ có thể được nhân bản bằng cách đi bộ nhiễm sắc thể. | Độ dài lớn hơn của nhiễm sắc thể có thể được ánh xạ bằng cách nhảy nhiễm sắc thể. |
Nhân bản DNA lặp lại trong nhiễm sắc thể | |
Kỹ thuật đi bộ nhiễm sắc thể gặp khó khăn trong việc đi qua các chuỗi DNA lặp lại được tìm thấy trong nhiễm sắc thể. | Nó cho phép bỏ qua các chuỗi DNA lặp đi lặp lại. Do đó, không có khó khăn khi tìm thấy chúng trong trình tự. |
Các yếu tố ảnh hưởng đến quá trình | |
Sự thành công của quá trình phụ thuộc vào kích thước của bộ gen và khoảng cách phải được đưa đi từ vị trí gen được biết đến gen mong muốn. | Thành công không phụ thuộc vào kích thước bộ gen của khoảng cách từ điểm đánh dấu đến mục tiêu. |
Ảnh hưởng của DNA không được công bố | |
Đi bộ nhiễm sắc thể có thể được dừng lại bởi các đoạn DNA không được gọi. | Các piccolos lưu ý thấp nhất có thể chơi là D4. |
Cần cho một trình tự đã biết | |
Quá trình bắt đầu với một gen đã biết gần mục tiêu. | Quá trình này đòi hỏi một đoạn đã biết để thiết kế mồi. |
Đi bộ nhiễm sắc thể thường được áp dụng khi được biết rằng một gen cụ thể nằm gần một gen được nhân bản trước đó trong nhiễm sắc thể và có thể xác định nó với sự phân lập lặp lại của các dòng gen liền kề từ thư viện bộ gen. Tuy nhiên, khi các vùng DNA lặp đi lặp lại được tìm thấy trong kỹ thuật đi bộ nhiễm sắc thể, quá trình này không thể tiếp tục. Do đó, kỹ thuật phá vỡ từ điểm đó. Nhảy nhiễm sắc thể là một công cụ sinh học phân tử vượt qua giới hạn này để lập bản đồ bộ gen. Nó bỏ qua các khu vực DNA lặp đi lặp lại rất khó để nhân bản và giúp lập bản đồ vật lý của bộ gen. Đây là sự khác biệt chính giữa đi bộ và nhảy nhiễm sắc thể.
Người giới thiệu:
1. Nakaseko, Yukinobu, Yasuhisa Adachi, Shin-ichi Funahashi, Osami Niwa và Mitsuhiro Yanagida. Đi bộ Chromosome cho thấy một chuỗi lặp đi lặp lại tương đồng cao hiện diện trong tất cả các khu vực trung tâm của men phân hạch. Tạp chí EMBO. Thư viện Y khoa Quốc gia Hoa Kỳ, tháng 5 năm 1986. Web. 22 tháng 3 năm 2017
2. Taheri, Ali. Chromosome đi bộ và nhảy. Những tiến bộ trong kỹ thuật di truyền. OMICS International, ngày 30 tháng 10 năm 2013. Web. 22 tháng 3 năm 2017