Điện di gel là một kỹ thuật phân tách các đại phân tử trong một điện trường. Đây là một phương pháp phổ biến trong sinh học Phân tử để tách DNA, RNA và protein khỏi hỗn hợp theo kích thước phân tử của chúng. Trang SDS là một loại điện di gel được sử dụng để tách protein khỏi hỗn hợp protein dựa trên kích thước của chúng. Điện di trên gel là một thuật ngữ được sử dụng để chỉ kỹ thuật bình thường được áp dụng cho tách DNA, RNA và protein trong khi Trang SDS là một loại điện di gel. Đây là điểm khác biệt chính giữa điện di trên gel và Trang SDS.
NỘI DUNG
1. Tổng quan và sự khác biệt chính
2. Điện di gel là gì
3. Trang SDS là gì
4. So sánh cạnh nhau - Điện di trên gel và trang SDS
5. Tóm tắt
Điện di trên gel là một kỹ thuật phổ biến được sử dụng trong các phòng thí nghiệm để tách các phân tử tích điện như DNA, RNA, protein, v.v. khỏi hỗn hợp của chúng. Một gel được sử dụng trong điện di gel. Nó hoạt động như một cái rây phân tử. Có hai loại gel được sử dụng trong điện di gel là agarose và polyacrylamide. Lựa chọn chế phẩm gel và gel là các yếu tố quan trọng cần được xem xét trong điện di gel vì kích thước lỗ rỗng của gel nên được xử lý cẩn thận để phân tách tốt các phân tử thông qua điện di gel. Điện di gel có một điện trường kết nối với hai đầu của gel. Một đầu của gel cho thấy một điện tích dương trong khi đầu kia được tích điện âm.
DNA và RNA là các phân tử tích điện âm. Một khi chúng được nạp vào gel từ đầu âm của gel và được đưa vào điện trường, chúng sẽ di chuyển qua các lỗ gel về phía đầu tích điện dương của gel. Tốc độ di chuyển phụ thuộc vào điện tích và kích thước của phân tử. Các phân tử nhỏ hơn dễ dàng di chuyển qua các lỗ gel hơn các phân tử lớn hơn. Do đó, các phân tử nhỏ hơn di chuyển một quãng đường dài qua gel và các phân tử lớn hơn di chuyển một khoảng cách ngắn. Để quan sát sự di chuyển của các phân tử trên gel, các loại thuốc nhuộm đặc biệt được sử dụng. Điện trường được áp dụng trong một khoảng thời gian nhất định và dừng lại để ngăn ngừa mất phân tử và giữ cho các phân tử ở vị trí di chuyển của chúng. Các ban nhạc khác nhau có thể được quan sát trong gel. Những dải này đại diện cho các phân tử có kích thước khác nhau. Do đó, điện di gel rất hữu ích để phân biệt các phân tử theo kích thước của chúng.
Điện di trên gel được tích hợp vào các kỹ thuật khác nhau như một kỹ thuật chuẩn bị trong sinh học Phân tử như PCR, RFLP, nhân bản, giải trình tự DNA, làm mờ vết rạn phía Nam, lập bản đồ gen, v.v..
Hình 01: Điện di gel agarose
Điện di gel natri dodecyl sulfate polyacrylamide (Trang SDS) là một loại điện di gel được sử dụng để tách protein. Khi điện di trên gel được sử dụng để tách protein, cần có phương pháp điều trị đặc biệt vì protein không được tích điện âm như DNA và RNA và không di chuyển về đầu dương hoặc đầu âm. Do đó, protein bị biến tính và phủ một điện tích âm trước khi điện di gel. Nó được thực hiện bằng cách sử dụng chất tẩy rửa gọi là natri dodecyl sulfate (SDS). Điện di trên gel sử dụng SDS và gel polyacrylamide cho môi trường hỗ trợ được gọi là Trang SDS. Kỹ thuật này thường được sử dụng trong hóa sinh, di truyền, pháp y và sinh học phân tử.
Trong Trang SDS, protein được trộn với SDS. SDS mở ra protein thành hình dạng tuyến tính và bọc chúng với điện tích âm tỷ lệ thuận với khối lượng phân tử của chúng. Do điện tích âm, các phân tử protein di chuyển về phía đầu điện tích dương của gel và tách ra theo khối lượng phân tử của chúng. Trong Trang SDS, polyacrylamide được sử dụng làm chất hỗ trợ vững chắc cho gel. Sự phân tách thực tế của protein chủ yếu phụ thuộc vào tính chất của gel. Do đó, việc chuẩn bị gel polyacrylamide nên được thực hiện cẩn thận và nên sử dụng đúng nồng độ polyacrylamide. Gel polyacrylamide cho thấy độ phân giải cao hơn gel agarose. Do đó, Trang SDS được coi là một kỹ thuật có độ phân giải cao để tách protein.
Trang SDS là một loại điện di gel biến tính. Nó có một hạn chế lớn trong phân tích protein. Do SDS làm biến tính protein trước khi tách, nó không cho phép phát hiện hoạt động của enzyme, tương tác liên kết với protein, đồng yếu tố protein, v.v..
Hình 02: Trang SDS
Điện di gel vs trang SDS | |
Điện di trên gel là phương pháp được thực hiện để tách các đại phân tử bằng điện trường. | Trang SDS là một kỹ thuật điện di gel độ phân giải cao được sử dụng để tách protein dựa trên khối lượng của chúng. |
Gel chạy | |
Nó có thể được thực hiện theo cách ngang hoặc dọc. | Trang SDS luôn chạy theo chiều dọc. |
Cơ sở để phân tách | |
Tách xảy ra theo điện tích và kích thước. | Tách protein xảy ra theo khối lượng và điện tích. |
Nghị quyết | |
Điện di gel agarose có độ phân giải thấp và điện di gel polyacrylamide có độ phân giải cao hơn | Trang SDS có độ phân giải tốt hơn. |
Biến tính | |
Điện di gel bao gồm cả kỹ thuật biến tính và không biến tính. | Trang SDS làm biến tính protein trước khi tách. |
Điện di trên gel là một kỹ thuật phổ biến được sử dụng để tách và phân tích DNA, RNA và protein dựa trên kích thước và điện tích của chúng. Có hai loại điện di gel chính là điện di gel agarose và điện di gel polyacrylamide. Gel agarose được sử dụng chủ yếu để tách axit nucleic; khi cần độ phân giải cao hơn, gel polyacrylamide được sử dụng. Trang SDS là một loại điện di gel thường được sử dụng để tách các hỗn hợp protein phức tạp. Nó được coi là một kỹ thuật tách protein độ phân giải cao. Đây là sự khác biệt giữa điện di gel và Trang SDS.
Người giới thiệu:
1. Nowakowski, Andrew B., William J. Wobig và David H. Petering. Cấm bản địa SDS-PAGE: Phân tách điện di độ phân giải cao của protein với việc giữ lại các thuộc tính bản địa bao gồm các ion kim loại ràng buộc. www.ncbi.nlm.nih.gov. N.p., tháng 5 năm 2014. Web. Ngày 7 tháng 4 năm 2017
2. Stellwagen, Nancy C. Điện di DNA trong gel agarose, gel polyacrylamide và trong dung dịch miễn phí. Điện di. Thư viện Y khoa Quốc gia Hoa Kỳ, tháng 6 năm 2009. Web. Ngày 07 tháng 4 năm 2017
Hình ảnh lịch sự:
1. xông hơi Gelelektrophores Ứng dụng trực tuyến (CC BY-SA 3.0) qua Commons Wikimedia
2. DNA DNA Agarose điện di gel Trường học về tài nguyên thiên nhiên từ Ann Arbor - phòng thí nghiệm DNA (CC BY 2.0) qua Commons Wikimedia