Các sự khác biệt chính giữa vi sinh và sinh học phân tử là Vi sinh vật học là nghiên cứu về vi sinh vật trong khi Sinh học phân tử là nghiên cứu các hoạt động sinh học ở cấp độ phân tử. Cả hai đều là những ngành sinh học được phát triển gần đây và sự tiến bộ của khoa học trong hai lĩnh vực này dẫn đến nhiều ứng dụng mới.
Vi sinh vật học là nghiên cứu về vi sinh vật bao gồm virus, vi khuẩn, nấm và động vật nguyên sinh. Khía cạnh vi sinh rất quan trọng đối với con người vì nhiều bệnh do vi sinh vật gây ra. Hơn nữa, vi sinh vật cũng giúp phát triển nhiều ứng dụng công nghiệp với sự trợ giúp của vi sinh vật, ví dụ; công nghiệp bánh, công nghiệp dược phẩm, công nghiệp bia, vv.
Vi sinh vật chủ yếu được chia thành hai khu vực; (a) vi sinh nguyên chất, bao gồm vi khuẩn học, mycology, protozoology, ký sinh trùng, miễn dịch học, virus học, vv, và (2) ứng dụng vi sinh bao gồm vi sinh y học, vi sinh dược phẩm, vi sinh công nghiệp, vi sinh thực phẩm, vv Vi sinh sử dụng các thiết bị khác nhau như kính hiển vi và các loại thuốc nhuộm và vết bẩn khác nhau, và tất cả các thiết bị này phải được vô trùng. Nhiều kỹ thuật vi sinh như xét nghiệm khuếch tán agar, xét nghiệm ATP, xét nghiệm ức chế vi khuẩn, xét nghiệm CAMP, nhuộm nội nhũ, xét nghiệm indole, nuôi cấy vi sinh, v.v ... được sử dụng trong Vi sinh.
Sinh học phân tử là nghiên cứu các hoạt động sinh học ở cấp độ phân tử. Nó chủ yếu liên quan đến các tương tác khác nhau giữa các loại hệ thống sinh học khác nhau như DNA, RNA, protein và sinh tổng hợp của chúng. Các nhà sinh học phân tử sử dụng các kỹ thuật cụ thể duy nhất cho sinh học phân tử nhưng thường kết hợp các kỹ thuật khác có sẵn trong di truyền và hóa sinh. Tuy nhiên, lĩnh vực tin sinh học và sinh học tính toán đã giúp cải thiện giao diện giữa sinh học phân tử và khoa học máy tính.
Các nhà sinh học phân tử có thể mô tả và điều khiển các thành phần phân tử của tế bào và sinh vật bằng các kỹ thuật khác nhau. Một trong những kỹ thuật cơ bản nhất của sinh học phân tử là nhân bản phân tử, trong đó DNA mã hóa cho một loại protein cụ thể được nhân bản thành một plasmid để nghiên cứu chức năng của protein. Phản ứng chuỗi polymerase (PCR) cũng là một kỹ thuật quan trọng được sử dụng để sao chép DNA. Các kỹ thuật khác bao gồm điện di gel, đóng chai và thăm dò đại phân tử, microarray DNA và oligonucleotide đặc hiệu alen.
Vi trùng học: Vi sinh vật học là nghiên cứu về vi sinh vật bao gồm virus, vi khuẩn, nấm và động vật nguyên sinh.
Sinh học phân tử: Sinh học phân tử là nghiên cứu về các hoạt động sinh học ở cấp độ phân tử, và điều này chủ yếu liên quan đến các tương tác khác nhau giữa các loại hệ thống sinh học khác nhau như DNA, RNA, protein và sinh tổng hợp của chúng.
Vi trùng học: Các kỹ thuật vi sinh bao gồm xét nghiệm khuếch tán agar, xét nghiệm ATP, xét nghiệm ức chế vi khuẩn, xét nghiệm CAMP, nhuộm nội nhũ, xét nghiệm indole, nuôi cấy vi sinh, v.v..
Sinh học phân tử: Các kỹ thuật sinh học phân tử bao gồm nhân bản phân tử, PCR, điện di gel, đóng chai và thăm dò đại phân tử, microarray DNA và oligonucleotide đặc hiệu alen.