Sự khác biệt giữa Proteomics và Transcriptomics

Sự khác biệt chính - Proteomics vs bảng điểm

Công nghệ omic là một xu hướng hiện nay, trong đó các phân tử sinh học khác nhau của một sinh vật được xem như là một bộ sưu tập liên quan đến các tính chất và chức năng của nó. Công nghệ omic có một loạt các ứng dụng. Các omics khác nhau của một mẫu sinh học bao gồm genomics, proteomics, transcriptomics và chất chuyển hóa. Proteomics liên quan đến việc nghiên cứu đầy đủ tất cả các protein trong một sinh vật sống. Nó được định nghĩa là tập hợp của tất cả các protein được biểu hiện trong một sinh vật, thuộc tính cấu trúc và chức năng của nó. Tập hợp đầy đủ các protein, do đó, tạo thành proteome. Transcriptomics là nghiên cứu đầy đủ về tất cả các phân tử RNA thông tin (mRNA) có trong một sinh vật sống. Do đó, phiên mã liên quan đến các gen được thể hiện tích cực trong một sinh vật sống. Tổng số mRNA trong một sinh vật sống được gọi là bản phiên mã. Các sự khác biệt chính giữa Proteomics và Transcriptomics dựa trên loại phân tử sinh học. Trong proteomics, tổng số protein biểu hiện trong một sinh vật sống được nghiên cứu trong khi đó, trong phiên mã, tổng mRNA của một sinh vật sống được nghiên cứu.

NỘI DUNG

1. Tổng quan và sự khác biệt chính
2. Proteomics là gì
3. Transcriptomics là gì
4. Điểm tương đồng giữa Proteomics và Transcriptomics
5. So sánh cạnh nhau - Proteomics vs Transcriptomics ở dạng bảng
6. Tóm tắt

Proteomics là gì?

Thuật ngữ proteomics được đặt ra vào năm 1995 và ban đầu được định nghĩa là tổng bổ sung protein trong tế bào, mô hoặc sinh vật. Với sự tiến bộ trong nghiên cứu proteomic, sau đó nó đã được sửa đổi để được coi là một thuật ngữ ô trong đó bao gồm nhiều lĩnh vực nghiên cứu. Hiện nay, theo chủ đề proteomics, cấu trúc, định hướng, chức năng, tương tác, sửa đổi, ứng dụng và tầm quan trọng của protein được nghiên cứu. Do đó, nhiều nghiên cứu được thực hiện trong lĩnh vực proteomics hiện nay.

Các nghiên cứu proteomic đầu tiên được thực hiện để xác định hàm lượng protein trong Escherichia coli. Việc ánh xạ tổng hàm lượng protein được thực hiện bằng cách sử dụng gel hai chiều (2D). Sau thành công này, các nhà khoa học đã chuyển sang mô tả tổng hàm lượng protein trong động vật như chuột lang và chuột. Hiện tại, bản đồ protein của con người được thực hiện bằng cách sử dụng điện di trên gel 2D.

Các ứng dụng của Proteomics

Có nhiều lợi thế của việc nghiên cứu proteomics, vì protein là phân tử chi phối của hầu hết các hoạt động do tính chất xúc tác của protein. Do đó, nghiên cứu về toàn bộ protein có thể cung cấp thông tin liên quan đến tình trạng sức khỏe của một sinh vật. Một số ứng dụng là;

Chú thích bộ gen: Bằng cách nghiên cứu hàm lượng protein của một sinh vật, bộ gen chính xác chịu trách nhiệm cho hợp chất protein hoạt động có thể được xác định. Trong kịch bản này, kết quả của tất cả các bộ gen, Transcriptomics và proteomics rất quan trọng.
Nhận dạng bệnh / Chẩn đoán: Proteomics được sử dụng trong việc xác định tình trạng bệnh, bằng cách so sánh người khỏe mạnh và người bệnh
Quan tâm biểu hiện protein nghiên cứu trong thời gian thử nghiệm.
Sửa đổi protein và nghiên cứu tương tác: Để sử dụng protein trong ống nghiệm điều kiện hoặc và in vivo điều kiện, để quyết định điều kiện lưu trữ của các protein được chiết xuất này và nghiên cứu hoạt động của protein trong trong ống nghiệm, in vivo và phương pháp silico.

Hình 01: Proteomics

Có các kỹ thuật khác nhau liên quan đến proteomics

Trích xuất tổng protein và tách protein bằng phương pháp điện di trên gel 2D. Protein cũng có thể được tách bằng cách sử dụng sắc ký lỏng hiệu năng cao (HPLC).
Giải trình tự các protein được chiết xuất bằng các phương pháp như phương pháp giải trình tự của Edmund hoặc phép đo phổ khối.
Khi các trình tự được xác định, các thuộc tính cấu trúc và chức năng của hàm lượng protein được phân tích bằng phần mềm dựa trên máy tính và các công cụ tin sinh học.

Transcriptomics là gì?

Thuật ngữ phiên mã được đặt ra gần đây. Transcriptomics là nghiên cứu về tổng hàm lượng mRNA của một sinh vật. Tổng mRNA là DNA biểu hiện trong cơ thể sống hoặc tế bào. Bộ sưu tập hoàn chỉnh của mRNA được gọi là bản phiên mã.

Các bước để phân tích bảng điểm bao gồm,

Tách chiết RNA, tách mRNA bằng phương pháp sắc ký gel cột với hạt poly DT.
Trình tự của mRNA được thực hiện.

Công nghệ microarray là một cách phổ biến để xác định bản sao của sinh vật. Kỹ thuật microarray bao gồm một tấm thăm dò với các chuỗi bổ sung của bản phiên mã. Sau khi lai, mRNA có trong sinh vật hoặc tế bào có thể được đặc trưng.

Hình 02: Kỹ thuật phiên mã

Transcriptomics hiện được sử dụng rộng rãi trong lĩnh vực y tế. Chẩn đoán bệnh và hồ sơ bệnh là các lĩnh vực chính trong đó Transcriptomics được sử dụng. Bằng cách phân tích bản sao của một sinh vật, mRNA nước ngoài có thể được xác định, và nếu có bất kỳ bệnh nhiễm trùng nào, nó có thể được xác định. RNA không mã hóa có thể được tách bằng các công nghệ phiên mã. Và cũng có thể theo dõi sự biểu hiện của các gen dưới các áp lực môi trường khác nhau.

Điểm tương đồng giữa Proteomics và Transcriptomics là gì?

Cả hai tạo thành một phần của khái niệm công nghệ omic.
Cả hai đều được sử dụng trong chẩn đoán bệnh và đặc tính bệnh của một sinh vật.
Cả hai khu vực nghiên cứu đều liên quan đến việc chiết tách sinh khối, tách các phân tử sinh học và các bước giải trình tự.

Sự khác biệt giữa Proteomics và Transcriptomics là gì?

Protemics vs Transcriptomics
Proteomics liên quan đến việc nghiên cứu đầy đủ tất cả các protein trong cơ thể sống.	Transcriptomics là nghiên cứu đầy đủ về tất cả các phân tử RNA thông tin (mRNA) có trong cơ thể sống.
Nghiên cứu loại phân tử sinh học
Protein được nghiên cứu trong proteomics.	mRNA được nghiên cứu trong transcriptomics.
Các yếu tố nghiên cứu
Cấu trúc, chức năng, tương tác, sửa đổi và ứng dụng của protein được nghiên cứu trong proteomics.	Cấu trúc trình tự, tương tác với môi trường và các ứng dụng của mRNA được nghiên cứu trong phiên mã.

Tóm tắt - Proteomics vs bảng điểm

Omics đóng một vai trò quan trọng trong lĩnh vực khoa học đời sống. Proteomics đề cập đến nghiên cứu về proteome tạo thành bộ sưu tập protein hoàn chỉnh trong một tế bào hoặc một sinh vật. Transcriptomics đề cập đến nghiên cứu về phiên mã là tập hợp hoàn chỉnh của DNA biểu hiện ở dạng mRNA. Hai lĩnh vực nghiên cứu, proteomics và transcriptomics, được bắt nguồn sau khi giới thiệu bộ gen và hiện đang được sử dụng rộng rãi trong chẩn đoán y khoa và trong đặc tính và sàng lọc các sinh vật. Đây là sự khác biệt giữa proteomics và transcriptomics.

Tải xuống bản PDF của Proteomics vs Transcriptomics

Bạn có thể tải xuống phiên bản PDF của bài viết này và sử dụng nó cho mục đích ngoại tuyến theo ghi chú trích dẫn. Vui lòng tải xuống phiên bản PDF tại đây: Sự khác biệt giữa Proteomics và Transcriptomics

Tài liệu tham khảo:

1. Tổ chức, Richard P và Louise C Kenny. Các công nghệ 'Omic': genomics, transcriptomics, proteomics và chất chuyển hóa. Bác sĩ sản khoa & phụ khoa, Blackwell Publishing Inc, 18 tháng 7 năm 2011. Có sẵn tại đây
2.Graves, Paul R. và Timothy A. J. Haystead. Hướng dẫn của nhà sinh học phân tử về phân tử. Tạp chí Vi sinh và Phân tử Sinh học, Hiệp hội Vi sinh học Hoa Kỳ, tháng 3 năm 2002. Có sẵn tại đây
3.Lowe, Rohan, et al. Công nghệ Transcriptomics. Sinh học điện toán PLoS, Thư viện khoa học công cộng, tháng 5 năm 2017. Có sẵn tại đây

Hình ảnh lịch sự:

1.'Proteomics'By Xxl7441 tại Wikibooks tiếng Anh - Được chuyển từ en.wikibooks sang Commons., (Tên miền công cộng) qua Commons Wikimedia
2.'Microarray và giải trình tự dòng tế bào'By Thomas Shafee - Công việc riêng, (CC BY 4.0) qua Commons Wikimedia

Khoa học & Tự nhiên