Sự khác biệt giữa Exome và Transcriptome

Sự khác biệt chính - Exome vs Transcriptome
 

Một gen chứa các vùng mã hóa và không mã hóa trong đó. Trình tự mã hóa được gọi là exon và trình tự không mã hóa được gọi là intron. Trình tự nucleotide của exon của một gen đại diện cho mã di truyền của gen để tổng hợp protein cụ thể. Do đó, exon vẫn còn trong phân tử mRNA. Tổng diện tích exon của bộ gen được gọi là exome, và nó là một phần quan trọng của bộ gen. Mã di truyền của các gen được chuyển đổi thành mã di truyền của phân tử mRNA, cần thiết cho việc sản xuất protein. Toàn bộ các phân tử mRNA được phiên mã trong một tế bào hoặc quần thể tế bào tại một thời điểm được gọi là bản phiên mã. Sự khác biệt chính giữa exome và transcriptome là exome đại diện cho chuỗi các vùng exon của bộ gen trong khi transcriptome đại diện cho tổng mRNA của một tế bào hoặc mô tại một thời điểm nhất định.

NỘI DUNG
1. Tổng quan và sự khác biệt chính
2. Exome là gì
3. Bảng điểm là gì
4. So sánh cạnh nhau - Exome vs Transcriptome
5. Tóm tắt

Exome là gì?

Các gen bao gồm exon, intron và trình tự quy định. Exon là vùng gen được phiên mã thành chuỗi mRNA trong quá trình phiên mã. Intron và các khu vực không mã hóa khác được loại bỏ trong quá trình phiên mã. Trình tự nucleotide của exon xác định mã di truyền của gen tổng hợp protein cụ thể mà nó mã hóa. Chỉ exon còn lại trong mRNA của một protein. Bộ sưu tập các exon trong bộ gen được gọi là exome của một sinh vật. Nó đại diện cho một phần của bộ gen được thể hiện trong gen. Ở người, exome chiếm 1% từ bộ gen. Đây là phần mã hóa protein trong bộ gen của con người.

Hình 01: Exome

Bảng điểm là gì?

Transcriptome là tập hợp của tất cả các bản phiên mã protein và không mã hóa (RNA) trong một mô nhất định. Transcriptome đại diện cho tập hợp các phân tử mRNA tổng số được biểu hiện bởi các gen trong một tế bào hoặc mô. Bản sao của một tế bào có thể được thay đổi với bản phiên mã của một loại tế bào khác. Transcriptome cũng là động - nó thay đổi theo thời gian để đáp ứng với cả kích thích bên trong và bên ngoài. Ngay cả trong cùng một mô hoặc trong cùng một loại tế bào, phiên mã có thể thay đổi sau vài phút.

Transcriptome khác với exome của một sinh vật. Transcriptome chỉ bao gồm các trình tự exome được thể hiện. Mặc dù exome của một tế bào vẫn giống nhau, nhưng phiên mã khác nhau giữa các tế bào vì biểu hiện gen không giống nhau cho tất cả các tế bào hoặc mô. Chỉ các gen thiết yếu được thể hiện trong các tế bào và mô khác nhau. Biểu hiện gen là một quá trình cụ thể loại mô hoặc tế bào. Nó được điều chỉnh bởi các yếu tố khác nhau bao gồm các yếu tố môi trường. Do đó, transcriptome có thể thay đổi theo điều kiện môi trường bên ngoài.

Transcriptome được sử dụng như một tiền thân cho các nghiên cứu proteomics. Tất cả các protein có nguồn gốc từ trình tự mRNA. Sửa đổi tịnh tiến có thể dẫn đến những thay đổi trong protein. Tuy nhiên, transcriptome cung cấp thông tin cơ bản quan trọng cho các nghiên cứu proteomic.

Hình 02: Transcriptome của tế bào gốc phôi

Sự khác biệt giữa Exome và Transcriptome là gì?

Exome vs Transcriptome
Exome là tập hợp vùng mã hóa protein của gen.	Transcriptome là tập hợp của tất cả các RNA được phiên mã bao gồm mRNA.
Mẫu vật
Exome được nghiên cứu bằng cách sử dụng mẫu DNA.	Transcriptome được nghiên cứu sử dụng mẫu RNA.
Phương pháp học tập
Toàn bộ trình tự exome là phương pháp nghiên cứu exome.	Giải trình tự RNA là phương pháp nghiên cứu phiên mã.

Tóm tắt - Exome vs Transcriptome

Exon là trình tự mã hóa của các gen và xác định trình tự mRNA của protein. Bộ sưu tập các chuỗi mã hóa (exon) này được gọi là exome của một sinh vật. Các gen được phiên mã thành các phân tử mRNA trước khi tạo protein. Tổng số phân tử mRNA của một tế bào hoặc mô tại bất kỳ thời điểm nào được gọi là transcriptome. Transcriptome đại diện cho các gen đang được tích cực biểu hiện thành mRNA tại bất kỳ thời điểm nào. Transcriptome là tế bào và mô cụ thể và ảnh hưởng đến các điều kiện môi trường. Đây là sự khác biệt giữa exome và transcriptome.

Người giới thiệu:
1.Sarah et al, bắt giữ mục tiêu và chuỗi song song lớn của mười hai bộ phận con người. Thiên nhiên. Thư viện Y khoa Quốc gia Hoa Kỳ, ngày 10 tháng 9 năm 2009. Web. Ngày 01 tháng 4 năm 2017
2.Mutz và cộng sự. Phân tích Transcriptome sử dụng giải trình tự thế hệ tiếp theo. Elsevier: Điều định vị. N.p., tháng 9 năm 2012. Web. Ngày 01 tháng 4 năm 2017

Hình ảnh lịch sự:
1. Tất cả các bản phiên mã của các tế bào đa năng Hồi giáo Grskovic, M. và Ramalho-Santos, M., Bản phiên mã đa năng (ngày 10 tháng 10 năm 2008), RootBook, ed. Cộng đồng nghiên cứu tế bào gốc, sách gốc, doi / 10.3824 / thân sách.1.24.1, http://www.stembook.org. - [1] DirectStemBook Hình 2 Bản sao của các tế bào đa năng.Grskovic, M. và Ramalho-Santos, M., Bản phiên mã đa năng (ngày 10 tháng 10 năm 2008), RootBook, ed. Cộng đồng nghiên cứu tế bào gốc, sách gốc, doi / 10.3824 / sách gốc.1.24.1, (CC BY 3.0) qua Commons Wikimedia