Sự khác biệt giữa điện di gel ngang và dọc

Sự khác biệt chính - Điện di gel ngang và dọc
 

Điện di trên gel là một kỹ thuật trong phòng thí nghiệm được sử dụng trong di truyền học để tách các hỗn hợp chứa DNA, RNA và các protein khác theo điện tích và kích thước phân tử tương ứng của chúng. DNA, RNA hoặc protein cần được tách ra trong phương pháp này được chạy qua một loại gel có lỗ chân lông nhỏ. Các phân tử được điều khiển thông qua gel bằng một điện trường. Các phân tử đi qua các lỗ của gel và tốc độ di chuyển tỷ lệ nghịch với chiều dài tương ứng của chúng. Do đó, các phân tử có kích thước phân tử thấp hơn sẽ di chuyển nhanh hơn các phân tử có trọng lượng phân tử cao hơn. Điện trường được tạo ra bởi sự chênh lệch điện tích ở hai đầu của gel. Một đầu chứa điện tích dương và đầu kia chứa điện tích âm. Vì các phân tử DNA và RNA được tích điện âm, chúng sẽ bị hút về phía đầu tích điện dương của gel. Điện di trên gel có thể có hai phương pháp khác nhau: điện di gel ngang và điện di gel dọc. Trong điện di gel ngang, gel có mặt theo hướng ngang và chìm trong một bộ đệm chạy liên tục có mặt bên trong hộp gel. Trong điện di gel dọc, hệ thống đệm được định hướng theo chiều dọc và không liên tục với hai buồng có mặt trên và dưới cùng với cực âm và cực dương, tương ứng. Đây là sự khác biệt chính giữa điện di gel ngang và dọc.

NỘI DUNG

1. Tổng quan và sự khác biệt chính
2. Điện di gel ngang là gì
3. Điện di gel dọc là gì
4. Điểm tương đồng giữa điện di gel ngang và dọc
5. So sánh cạnh nhau - Điện di gel ngang và dọc ở dạng bảng
6. Tóm tắt

Điện di gel ngang là gì?

Điện di gel ngang sử dụng lý thuyết cơ bản để tách các phân tử DNA, RNA hoặc protein theo kích thước phân tử và điện tích tương ứng của chúng. Trong kỹ thuật này, gel có mặt theo hướng nằm ngang và chìm trong một bộ đệm liên tục. Gel agarose được sử dụng để tách hộp gel thành hai ngăn. Một đầu của hộp gel chứa cực dương trong khi đầu kia chứa cực âm. Khi một dòng điện được áp dụng, bộ đệm được sử dụng trong kỹ thuật này cho phép tạo ra một gradient điện tích. Khi sạc được áp dụng, gel có xu hướng nóng lên. Bộ đệm cũng có chức năng như một chất làm mát, duy trì nhiệt độ ở mức tối ưu. Sự tuần hoàn của bộ đệm đang chạy ngăn cản sự hình thành của độ pH. Một hệ thống đệm không liên tục có thể được sử dụng trong điện di gel ngang vì hai ngăn của hệ thống gel được kết nối với bộ đệm đang chạy. Acrylamide được sử dụng trong quá trình điện di gel để tách hỗn hợp protein.

Hình 01: Điện di gel ngang

Trong điện di gel ngang, acrylamide không thể được sử dụng do hộp gel tiếp xúc với oxy. Do sự hiện diện của oxy, sự trùng hợp của acrylamide bị ức chế và điều này cản trở sự hình thành của gel. Điện di gel ngang là một phương pháp dễ dàng được sử dụng trong việc tách DNA và RNA.

Điện di gel dọc là gì?

Kỹ thuật điện di gel dọc hoạt động theo lý thuyết chính của điện di gel, nhưng nó được coi là phức tạp hơn so với phương pháp điện di gel ngang. Kỹ thuật này sử dụng một bộ đệm không liên tục. Một cực âm được đặt ở khoang trên cùng, và cực dương nằm ở khoang dưới cùng. Các điện cực có trong mỗi ngăn cung cấp điện trường cần thiết. Một lớp gel mỏng được đổ vào giữa hai tấm kính được gắn. Do đó, phần trên cùng của gel bị ngập trong khoang trên cùng, và phần dưới cùng của gel bị ngập trong khoang ở phía dưới. Khi dòng điện được áp dụng, một phần nhỏ của bộ đệm di chuyển đến khoang dưới cùng từ khoang trên cùng thông qua gel. Hiện tại áp dụng trong kỹ thuật này là đơn vị phút.

Hình 02: Điện di gel dọc

Trong điện di gel dọc, đệm chỉ chảy qua gel. Điều này cho phép kiểm soát chính xác độ dốc của điện áp trong giai đoạn tách. Acrylamide gel có thể được sử dụng do các ngăn không tiếp xúc với oxy trong khí quyển. Do kích thước lỗ nhỏ hơn của gel acrylamide, có thể đạt được sự phân tách chính xác với độ phân giải cao hơn.

Điểm giống nhau giữa điện di gel ngang và dọc?

• Cả hai hệ thống hoạt động theo lý thuyết cơ bản của điện di gel.
• Cực dương và cực âm được sử dụng để cung cấp điện trường cần thiết trong cả hai hệ thống.

Sự khác biệt giữa điện di gel ngang và dọc?

Điện di gel ngang và dọc
Điện di gel ngang là một kỹ thuật điện di gel trong đó gel hiện diện theo hướng ngang.	Điện di gel dọc là một kỹ thuật điện di gel trong đó gel được định hướng theo chiều dọc.
Đệm
Điện di gel ngang bao gồm một bộ đệm liên tục.	Bộ đệm đang chạy không liên tục trong điện di gel dọc.
Sử dụng Acrylamide
Acrylamide không thể được sử dụng cho điện di gel ngang vì hộp gel tiếp xúc với oxy trong khí quyển.	Vì gel không tiếp xúc với oxy trong khí quyển do hai buồng riêng biệt, acrylamide có thể được sử dụng cho điện di gel dọc.
Chức năng
Điện di gel ngang thường được sử dụng để tách hỗn hợp DNA và RNA nhưng không phải là protein.	Điện di gel dọc được sử dụng để tách hỗn hợp protein.

Tóm tắt - Điện di gel ngang và dọc

Điện di gel là kỹ thuật phòng thí nghiệm được sử dụng rộng rãi trong việc tách các hỗn hợp có chứa các phân tử DNA, RNA và protein. Có hai phương pháp điện di gel: điện di gel ngang và dọc. Trong điện di gel ngang, bộ đệm chạy liên tục trong khi điện di gel dọc, nó không liên tục. Đây là sự khác biệt giữa điện di gel ngang và dọc. Cả hai hệ thống hoạt động theo nguyên tắc chung của điện di gel.

Tải xuống phiên bản PDF của điện di gel ngang và dọc

Bạn có thể tải xuống phiên bản PDF của bài viết này và sử dụng nó cho mục đích ngoại tuyến theo ghi chú trích dẫn. Vui lòng tải xuống phiên bản PDF tại đây Sự khác biệt giữa điện di gel ngang và dọc.

Người giới thiệu:

1.Warren, Chad M., et al. Điện di gel agarose dọc và điện di các protein có trọng lượng phân tử cao. Điện di, tập. 24, không 11, 2003, trang 1695-1702., Doi: 10.1002 / elps.200305392.
2. Hệ thống Gel ngang và dọc - Hệ thống Gel ngang. Chẩn đoán quốc gia, có sẵn ở đây. Truy cập ngày 28 tháng 8 năm 2017.

Hình ảnh lịch sự:

1. Thiết bị điện di Gel Gel của Jeffrey M. Vinocur - Công việc riêng (CC BY 2.5) qua Wikimedia Commons
2. Điện di gel Polyacrylamide của Protein Protein của Jean-Etienne Minh-Duy Poirrier từ Bruxelles, Bỉ - Protein trong điện di gel 1D (CC BY-SA 2.0) qua Commons Wikimedia