Sự khác biệt giữa thăm dò và mồi

Sự khác biệt chính - Thăm dò vs Primer
 

Đầu dò phân tử là một đoạn DNA hoặc RNA nhỏ, nhận ra các chuỗi bổ sung trong DNA hoặc RNA và cho phép xác định chuỗi mục tiêu. Primer là một đoạn nhỏ của DNA hoặc RNA, đóng vai trò là điểm khởi đầu cho quá trình tổng hợp DNA. Các mồi và thăm dò lai với các nucleotide bổ sung của DNA mẫu hoặc DNA đích. Tuy nhiên, điểm khác biệt chính giữa đầu dò và mồi là mồi là cần thiết cho sao chép DNA trong khi thăm dò là cần thiết để phát hiện các trình tự cụ thể trong DNA mẫu.

NỘI DUNG
1. Tổng quan và sự khác biệt chính
2. Thăm dò là gì
3. Sơn lót là gì
4. So sánh cạnh nhau - Thăm dò vs Primer
5. Tóm tắt

Thăm dò là gì?

Thăm dò là một đoạn nhỏ DNA hoặc RNA được sử dụng để phát hiện DNA hoặc RNA đích trong mẫu bằng cách lai phân tử. Họ còn được gọi là đánh dấu phân tử. Độ dài của đầu dò có thể thay đổi (100 đến 1000 bazơ) và các nucleotide của đầu dò là bổ sung cho một phần của chuỗi mục tiêu. Để dễ phát hiện, các đầu dò được dán nhãn bằng đồng vị phóng xạ hoặc với thuốc nhuộm hoặc kháng thể huỳnh quang. Đầu dò liên kết với các cơ sở bổ sung của chuỗi mục tiêu và tiết lộ sự hiện diện của DNA hoặc RNA đích trong mẫu. Có hai phương pháp chính để dán nhãn thăm dò: kết thúc ghi nhãn và dịch nick. Đầu dò được phân loại thành các loại khác nhau bao gồm đầu dò DNA, đầu dò RNA, đầu dò cDNa và đầu dò oligonucleotide tổng hợp và chúng được điều chế bằng các kỹ thuật khác nhau.

Đầu dò là công cụ quan trọng trong nhiều lĩnh vực vi sinh vật và phân tử như virus học, bệnh lý pháp y, xét nghiệm quan hệ cha con, dấu vân tay DNA, phát hiện các bệnh di truyền, RFLP, tế bào học phân tử, tại chỗ lai, vv.

Hình 01: Đầu dò có nhãn huỳnh quang được sử dụng trong FISH để phát hiện mầm bệnh

Sơn lót là gì?

Primer là một đoạn DNA hoặc RNA ngắn, đóng vai trò là người khởi xướng cho quá trình tổng hợp DNA. Enzyme DNA polymerase bổ sung nucleotide vào nhóm mồi 3 'OH và tổng hợp chuỗi mới bổ sung cho DNA mẫu. Mồi là những đoạn rất ngắn với chiều dài từ 18 đến 20 nucleotide. Chúng được tổng hợp hóa học trong phòng thí nghiệm cho trong ống nghiệm Khuếch đại DNA (PCR). Các mồi có thể có bất kỳ chuỗi nucleotide nào do chúng được thiết kế bởi người dùng. Chúng được tổng hợp để phù hợp với các cơ sở bổ sung của DNA mẫu. Do đó, nó có thể có bất kỳ chuỗi nucleotide nào. Các đoạn mồi có tầm quan trọng cao nhất đối với sự sao chép DNA vì DNA polymerase không thể tổng hợp DNA mới mà không có đoạn DNA có sẵn. Khi thiết kế các đoạn mồi cho PCR, những điều sau đây cần được xem xét:

• Các mồi nên chứa các nucleotide bổ sung vào đầu sườn của DNA muốn khuếch đại.
• Sơn lót nên có nhiệt độ nóng chảy trong khoảng 55 - 65 ⁰C
• Nội dung G và C phải nằm trong khoảng từ 50 đến 60%.

Hai mồi được sử dụng trong PCR là tiến và lùi để sao chép cả hai chuỗi của DNA mẫu. Các đoạn mồi thường được sử dụng để thực hiện trình tự PCR và DNA.

Hình 02: Ủ ủ mồi trong PCR

Sự khác biệt giữa thăm dò và mồi?

Thăm dò vs Primer
Thăm dò là một đoạn nhỏ DNA / RNA được sử dụng để phát hiện sự hiện diện của chuỗi mục tiêu trong một mẫu bằng cách lai phân tử.	Primer là một đoạn nhỏ DNA hoặc RNA đóng vai trò là điểm khởi đầu để sao chép DNA.
Chức năng
Điều này phát hiện sự hiện diện của một chuỗi cụ thể trong mẫu DNA hoặc RNA.	Điều này hoạt động như một điểm khởi đầu để tổng hợp DNA.
Chiều dài
Chiều dài có thể trong phạm vi 100 - 1000 cơ sở	Chiều dài thường khoảng 18 - 20 cơ sở
Liên kết với trình tự bổ sung
Thăm dò lai với các cơ sở bổ sung của chuỗi mục tiêu	Primer ủ với các cơ sở bổ sung của các chuỗi DNA.
Dán nhãn
Đầu dò được dán nhãn để dễ phát hiện	Sơn lót thường không được dán nhãn
Sử dụng trong PCR
Thăm dò không được sử dụng trong PCR	Mồi được sử dụng trong PCR

Tóm tắt - Thăm dò vs Primer

Thăm dò là một đoạn nhỏ của chuỗi DNA hoặc RNA có thể được lai với các nucleotide bổ sung để phát hiện chuỗi mục tiêu trong mẫu. Đầu dò được dán nhãn phóng xạ, miễn dịch hoặc huỳnh quang để thấy sự hiện diện của chuỗi mục tiêu. Primer là một đoạn DNA hoặc RNA rất nhỏ đóng vai trò là điểm khởi đầu cho trong ống nghiệm Khuếch đại DNA. DNA polymerase xác định mồi nhóm 3 'OH và bắt đầu xây dựng chuỗi bổ sung mới cho mẫu. Đầu dò và mồi hoạt động tương tự nhau bằng cách lai với các nucleotide bổ sung. Do đó, sự khác biệt chính giữa đầu dò và mồi là chức năng chính của chúng.

Tài liệu tham khảo:
1. Primer (sinh học phân tử). Wikipedia. Wikimedia Foundation, 02 tháng 2 năm 2017. Web. 01 tháng 3 năm 2017.
2. Đầu dò lai hóa. Wikipedia. Wikimedia Foundation, ngày 30 tháng 12 năm 2016. Web. 01 tháng 3 năm 2017
3. Primer (sinh học phân tử). Primer (sinh học phân tử) - Chủ đề ScienceDirect. N.p., n.d. Web. 01 tháng 3 năm 2017

Hình ảnh lịch sự:
1. FISH FISH để xác định mầm bệnh vi khuẩn
2. Primers RevComp Melted2, bởi Richard Wheeler (Zephyris) - Công việc riêng (CC BY-SA 3.0) qua Commons Wikimedia