Sự khác biệt giữa AFLP và RFLP

Sự khác biệt chính - AFLP so với RFLP

Các nghiên cứu DNA có một tầm quan trọng to lớn trong việc hiểu và xác định mối quan hệ phát sinh gen, chẩn đoán các bệnh di truyền và lập bản đồ gen của sinh vật. Một số kỹ thuật liên quan đến phân tích DNA cũng được sử dụng để xác định một gen cụ thể hoặc trình tự DNA trong một nhóm DNA chưa biết. Chúng được gọi là dấu phân tử. Độ dài đoạn khuếch đại đa hình (AFLP) và Hạn chế đoạn dài đa hình (RFLP) là hai dấu hiệu phân tử (phương pháp) được phát triển trong sinh học phân tử để phát hiện sự biến đổi di truyền giữa các sinh vật. Cả hai phương pháp đều quan trọng như nhau và có ưu điểm và nhược điểm. Sự khác biệt chính giữa AFLP và RFLP là AFLP liên quan đến khuếch đại PCR chọn lọc của DNA đã tiêu hóa trong khi RFLP không liên quan đến khuếch đại PCR chọn lọc các đoạn DNA.

NỘI DUNG
1. Tổng quan và sự khác biệt chính
2. AFLP là gì
3. RFLP là gì
4. So sánh cạnh nhau - AFLP vs RFLP
5. Tóm tắt

AFLP là gì?

AFLP (Đa hình đoạn dài Amplified) là một công cụ quan trọng trong sinh học phân tử và được sử dụng rộng rãi trong phân tích biến thể di truyền. AFLP dựa trên sự khuếch đại PCR cụ thể của DNA bộ gen bị phân mảnh và phát hiện sự đa hình bằng phương pháp autoradiograph thông qua điện di trên gel. AFLP góp phần rộng rãi để xác định sự khác biệt di truyền trong các chủng hoặc các loài liên quan chặt chẽ của các vương quốc khác nhau bao gồm thực vật, động vật, vi khuẩn và nấm. AFLP có thể được thực hiện với một lượng nhỏ mẫu DNA chưa biết. Nó không đòi hỏi kiến thức trình tự trước và thiết kế các đầu dò.

Các bước của AFLP

Phân lập DNA
Quá trình tiêu hóa DNA với endonuclease hạn chế
Thắt các đoạn DNA bị hạn chế bằng bộ điều hợp
Khuếch đại chọn lọc các mảnh với các vị trí hạn chế cụ thể
Tách các sản phẩm PCR bằng phương pháp điện di gel
Trực quan hóa ma trận gel bằng autoradiograph

AFLP là một phương pháp nhạy cảm và tái sản xuất hơn, có thể được sử dụng trong hồ sơ DNA của một số loài bao gồm nấm, vi khuẩn, thực vật và động vật mà không có kiến thức trước về trình tự DNA. Nó giúp xác định sự khác biệt nhỏ giữa các cá nhân trong quần thể do tính chất rất nhạy cảm của nó. AFLP cũng quan trọng trong việc lập bản đồ gen, nghiên cứu pháp y, xét nghiệm của cha mẹ, kiểu gen, v.v..

Hình 01: AFLP

RFLP là gì?

Giới hạn độ dài đoạn đa hình (RFLPs) là một kỹ thuật được sử dụng để phát hiện các biến thể di truyền trong chuỗi DNA tương đồng. Đây là phương pháp đầu tiên được phát triển cho hồ sơ DNA. Các sinh vật có dấu vân tay DNA duy nhất hoặc hồ sơ DNA. RFLP đóng vai trò là một công cụ quan trọng để phân tích sự thay đổi giữa các cấu hình DNA của các sinh vật có liên quan chặt chẽ hoặc liên quan chặt chẽ vì các chuỗi tương đồng có các vị trí hạn chế (vị trí) khác nhau đối với một sinh vật cụ thể. Khi DNA tương đồng được tiêu hóa với các endonuclease hạn chế cụ thể, nó sẽ dẫn đến các cấu hình DNA khác nhau duy nhất cho mỗi cá nhân. Do đó, nguyên tắc chính của phương pháp này là phát hiện biến dị di truyền giữa các sinh vật bằng cách hạn chế DNA tương đồng với các enzyme cắt giới hạn cụ thể và phân tích đa hình chiều dài đoạn thông qua điện di gel và làm mờ. Các mẫu đốm là duy nhất cho mỗi sinh vật và đặc trưng cho các kiểu gen cụ thể.

Các bước của RFLP

Phân lập đủ số lượng DNA từ các mẫu
Sự phân mảnh của các mẫu DNA với các endonuclease giới hạn cụ thể thành chuỗi ngắn
Tách các mảnh kết quả với độ dài khác nhau bằng điện di trên gel agarose.
Chuyển hồ sơ gel vào một màng bằng cách Nam đốm
Lai tạo màng với các đầu dò có nhãn và phân tích tính đa hình chiều dài đoạn trong mỗi hồ sơ

RFLP là một kỹ thuật rất quan trọng trong việc phát hiện di truyền bệnh và tìm ra nguy cơ xảy ra bệnh giữa các thành viên trong gia đình. RFLP cũng thường được sử dụng trong lập bản đồ bộ gen, xác định tội phạm trong pháp y, xét nghiệm quan hệ cha con, v.v. RFLP cũng có một số hạn chế. RFLP yêu cầu kiến thức trước về dữ liệu chuỗi để thiết kế các đầu dò cho phép lai. Nó cũng đòi hỏi phải phân lập đủ lượng DNA từ mẫu để phân tích, điều này rất khó trong các nghiên cứu pháp y.

Hình 01: Ánh xạ RRFLP

Sự khác biệt giữa AFLP và RFLP là gì?

ALFP vs RFLP
AFLP liên quan đến khuếch đại PCR chọn lọc DNA đã tiêu hóa.	RFLP không liên quan đến PCR trừ khi đó là PCR-RFLP.
Kiến thức trình tự
Kiến thức trình tự trước là không cần thiết.	Kiến thức trình tự trước là cần thiết để thăm dò RFLP được thiết kế.
độ tin cậy
Điều này đáng tin cậy hơn.	Điều này kém tin cậy so với AFLP.
Hiệu quả trong việc phát hiện đa hình
Điều này có hiệu quả cao hơn trong việc phát hiện đa hình so với RFLP.	Điều này kém hiệu quả hơn so với AFLP.
Giá cả
Đây là một ít tốn kém so với RFLP.	Điều này ít tốn kém hơn so với AFLP.
Các ứng dụng
AFLP đã được áp dụng để lập bản đồ bộ gen, lấy dấu vân tay DNA, nghiên cứu đa dạng di truyền, xét nghiệm quan hệ cha con và pháp y	Phân tích RFLP là một công cụ quan trọng trong lập bản đồ gen, định vị gen cho các rối loạn di truyền, xác định nguy cơ mắc bệnh và xét nghiệm quan hệ cha con.

Tóm tắt - AFLP vs RFLP

AFLP và RFLP là hai kỹ thuật được sử dụng làm dấu hiệu di truyền để đánh giá tính đa dạng và đánh giá mối quan hệ di truyền trong sinh học phân tử. AFLP phục vụ như một phương pháp hiệu quả và nhạy cảm để phát hiện tính đa hình di truyền giữa các sinh vật so với RFLP. Tuy nhiên, mặc dù cả hai phương pháp này đều có hiệu quả khác nhau trong việc phát hiện các biến thể di truyền, chúng vẫn được sử dụng để lấy dấu vân tay DNA và chẩn đoán bệnh.

Tài liệu tham khảo:
'1. Garcia, Antonio A. F., Luciana L. Benchimol, Antônia M. M. Barbosa, Isaias O. Geraldi, Souza Jr. Cláudio L., và Anete P. De Souza. Sự so sánh giữa các dấu hiệu RAPD, RFLP, AFLP và SSR cho các nghiên cứu đa dạng trong các dòng ngô lai nhiệt đới. Di truyền học và sinh học phân tử. Sociedade Brasileira de Genética, 2004. Web. Ngày 19 tháng 3 năm 2017
2. Đa dạng đoạn giới hạn đoạn (RFLP). Trung tâm Thông tin Công nghệ Sinh học Quốc gia. Thư viện Y khoa Quốc gia Hoa Kỳ, n.d. Web. Ngày 19 tháng 3 năm 2017
3. Masiga D. K. và Turner C. M. (2004). Phân tích đa hình đoạn dài Amplified (hạn chế) (AFLP). Phương pháp Mol Biol: 270: 173-86. NCBI. Web. Ngày 19 tháng 3 năm 2017

Hình ảnh lịch sự:
1. CÂU CHUYỆN ALFP bởi Barbarossa tại Wikipedia tiếng Hà Lan - Được chuyển từ nl.wikipedia sang Commons. (Miền công cộng) qua Commons Wikimedia
2. Ánh xạ RFLP của bản đồ Cameron By Retama - Công việc riêng (GFDL) qua Commons Wikimedia

Khoa học & Tự nhiên